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【视频复盘】在CRISPR编辑的细胞系中使用数字PCR进行标记拷贝数评估

11月19日欧洲分子生物学实验室研究员Moritz Kueblbeck于Genomeweb平台在线分享“ 在CRISPR编辑的细胞系中使用数字PCR进行标记拷贝数评估”的相关知识。

主讲人介绍:

Moritz Kueblbeck在德国海德堡的癌症研究中心(DKFZ)做了八年的研究员。2014年,他加入了Jan Ellenberg在海德堡的欧洲分子生物学实验室,在不同实验室的项目中,他使用CRISPR/Cas9方法利用内源性的标记蛋白(在HeLa和U-2 OS细胞进行不同标签的纯合敲入)进行人类细胞系基因组编辑。

内容简介

• 荧光蛋白或自标记是使用荧光显微镜研究活细胞中蛋白质动力学的宝贵工具。然而,定量成像需要目标蛋白(POI)的生理表达水平,特别是当需要研究POI的化学计量相互作用时。

• CRISPR使研究人员能够标记几乎任何感兴趣的目标基因,使其可以研究相应POI的生理表达水平。然而,正确编辑细胞克隆的产生和选择——即标记等位基因的预期数量和缺乏额外的整合——需要对标记的拷贝数进行定量评估。

• 探讨dPCR是一种快速、可靠的荧光标记CRISPR编辑细胞定量检测方法。

视频分享:


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